Τα ερευνητικά του ενδιαφέροντα αφορούν την Πληθυσμιακή Γενετική και Γονιδιωματική και τις εφαρμογές τους στο πεδίο της Γενετικής Βελτίωσης ζωικών ειδών εκτροφής. Η διερεύνηση των μηχανισμών προσαρμογής των ειδών αυτών στο θερμικό στρες, το οποίο είναι απόρροια της κλιματικής αλλαγής, είναι ιδιαίτερης σημασίας για την βιωσιμότητα των μονάδων παραγωγής και για την εξασφάλιση της ευζωίας των ζώων. Για το σκοπό αυτό, εφαρμόζονται μέθοδοι αλληλούχησης γονιδιώματος και τρανσκριπτόματος νέας γενιάς (Next Generation Sequencing, NGS) σε συνδυασμό με αναλύσεις βιοπληροφορικής, παρέχοντας την δυνατότητα ολιστικής προσέγγισης και μελέτης των βιολογικών μηχανισμών που ευθύνονται για την εμφάνιση των επιθυμητών φαινοτύπων των ζώων. Επιπλέον, τα ερευνητικά του ενδιαφέροντα αφορούν και την μελέτη της γενετικής ποικιλότητας των αυτόχθονων φυλών, οι οποίες διαθέτουν μοναδικά χαρακτηριστικά και η διατήρησή τους είναι πρωταρχικός στόχος, καθώς αποτελούν αναντικατάστατες πηγές βιοποικιλότητας και συνεισφέρουν και στην παραγωγή προϊόντων με Προστατευμένη Ονομασία Προέλευσης (ΠΟΠ), με ιδιαίτερη οικονομική αξία για τον τόπο.